学校中长期发展的总体目标是：到2020年乃至更长时间，建设成为一所以军事医学为龙头，以临床医学为主干，以基础医学为支撑，学科协调发展，学术大师汇集，育人质量一流，创新能力突出，军事特色鲜明，文化氛围浓郁，办学条件优良，具有较高国际知名度的高水平研究型军医大学。
     根据总体目标，今后一个时期学校发展的具体目标是：
     ——在人才培养方面： 本科教育的基础地位进一步强化，学员专业能力和综合素质稳步提升；研究生教育水平进一步提高，研究生创新精神和创新能力显著增强；任职教育培训体系科学完备，学员具有较强任职能力和较大发展潜力，形成学历教育与任职教育并重，研究生教育与本科生教育同步发展的格局，成为高素质人才的培养基地。
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    学校发展规划
    人才培养规划
    学科建设规划

    基于奋斗目标和发展战略，学校今后一个时期特别是未来五年的主要建设任务是：
     （一）以培养高素质创新人才为根本，不断深化教育教学改革
     加快任职教育发展步伐。
     不断完善人才培养模式。
     着力创新人才培养机制。
     （二）以增强保障打赢能力为要务，切实加紧军事斗争卫勤准备
     完善卫勤教育训练体系。
     提升军事医学科研水平。
     提高服务部队质量水平。
     （三）以打造一流学术梯队为关键，持续加快人才队伍建设步伐
     着力加强拔尖人才的培养集聚。
     大力深化激励机制的改革创新。
     努力营造人尽其才的良好环境。 ......